在对接上海，建设“生态屏障、产业腹地、创新之都、文化名城”于一体的上海北大门基调下，通州湾示范区管委会与上海理工大学科技园开展密切合作，共建上海理工大学科技园南通基地，双方于2016年1月签署合作协议，共同上海理工大学国家大学科技园南通基地, 全面推进产学研合作，推动通自主创新发展，结合通洲湾重点产业发展需求，充分发挥上海理工大学科教优势，大力提升通州湾经济发展质量。总体定位于“制造产业科技加速器”，以科技项目产业化为目标，发挥研发创新、技术转移、创业孵化、科技服务和人才培训五大功能，成为通州湾科技创新和产业结构调整的示范基地。

    基地总规划6万平方米，建立孵化、产业平台，进行专业化运作，为入驻企业提供配套的科技综合服务一期载体依托电子商务城8000平方米，2017年实际拨付使用面积4115平方米，2019年拟托管运营厂房面积72766㎡。

已托管运营的载体有通州湾电子商务城6#4115平方米，位于示范区黄河路8号。土地性质为商业用地。使用规划：独立办公，众创空间载体，企业注册。

通州湾国有标准厂房一期、二期的运营委托正在申请中，计划2019年获得运营委托权。厂房总面积72677㎡。一期载体已备案江苏省级科技企业孵化器。发展规划：国家级孵化器，江苏省双创示范基地，产业化基地。

南通基地积极招商引资，搭建服务平台，对接企业需求。接待来访客户57家，土地需求5家；厂房租赁29家；三产企业20家。

服务平台搭建：10家第三方服务供应商（道业咨询、指南针、金点财务、博尚企业管理等）；对接技术需求企业2家。